El Museo del Desierto ofrece diversas secciones o pabellones:
• Pabellón I, El Desierto y su pasado. Se presentan los rasgos y características del desierto y las diferentes eras geológicas por las que ha transcurrido la formación de la Tierra y la vida.
• Pabellón II, El hombre y el desierto: Un espacio de encuentros. Trata el tema de los grupos nómadas que habitaron el desierto hace aproximadamente 12 mil años, la época de la conquista, la colonización del noreste de México y la transformación de los usos de la tierra y los oficios.
• Pabellón III, Evolución y biodiversidad. Se muestra la fauna que habitó Norteamérica durante la última era glaciar y como las especies que actualmente habitan el desierto que hoy vivimos, se han adaptado a las condiciones actuales.
• Pabellón IV, El laboratorio de la vida. Se exhiben más de 25 especies de reptiles. Además en el Biodomo se hace una representación del medio ambiente que se presentaba en Coahuila hace más de 70 millones de años.
• DESIERTO VIVIENTE. Es un proyecto del Museo del Desierto el cual incluye muestras de especies del desierto vivas. Su objetivo es acercar a nuestros visitantes a conocerlas para fomentar su protección a través de su conservación e investigación.
http://www.culturacoahuila.gob.mx/site/directorio/museos/museo-del-desierto