羊卓雍错位于西藏自治区山南市浪卡子县雅鲁藏布江南岸，位于年楚河－羊卓雍错断裂带南面的地层陷落洼地，后来经过冰川作用积水而成为堰塞湖。该湖原本是外流湖，湖水经墨曲汇流入雅鲁藏布江，落差达到900米。后来，由于山地抬升，气候趋于干旱，水位逐渐下降，进入雅鲁藏布江的水道被堵，该湖遂逐渐变成内陆湖。湖水主要来自冰雪融水及泉水，流入羊卓雍错的河流主要分布在湖南岸、东南岸、西岸，集水面积达到6100平方公里。湖体自身调节水位，年最高水位在9月至10月出现，最低水位在5月至7月出现。羊卓雍错湖面海拔4441米。